Sabtu, 10 Februari 2018

MIKROBIOLOGI LINGKUNGAN : DEFINISI

Credit by google.com

Apa yang terbesit di dalam benakmu ketika mendengar kata mikrobiologi dan lingkungan? Apakah DNA? Siklus nitrogen? Virus? Mikroba-mikroba pada tanah, udara serta air? Apakah hanya itu saja?
Ngomong-ngomong… bicara tentang Mikrobiologi Lingkungan, kita berbicara mengenai mikroba dan perannya ketika berkolaborasi dilingkungan (tanah, air, udara). Hal lain yang menjadi menarik pun, salah satunya adalah mengenai isolasi mikroba dari suatu tempat (tempat yang unik).

Secara umum, mikrobiologi lingkungan adalah studi tentang komposisi dan fisiologi komunitas mikroba di lingkungan. Lingkungan dalam hal ini berarti tanah, air, udara dan sedimen yang menutupi planet ini dan juga dapat mencakup hewan dan tumbuhan yang mendiami daerah-daerah ini. Mikrobiologi lingkungan juga mencakup studi mikroorganisme yang ada di lingkungan buatan seperti bioreaktor. Biologi molekuler telah merevolusi studi mikroorganisme di lingkungan dan memperbaiki pemahaman kita tentang komposisi, filogeni, dan fisiologi komunitas mikroba.
Toolbox molekuler saat ini mencakup serangkaian teknologi berbasis DNA dan metode baru untuk studi RNA dan protein yang diambil dari sampel lingkungan. Saat ini ada penekanan utama pada penerapan pendekatan "omics" untuk menentukan identitas dan fungsi mikroba yang mendiami lingkungan yang berbeda. Kehidupan mikroba sangat beragam dan mikroorganisme secara harfiah menutupi planet ini. Diperkirakan kita mengetahui kurang dari 1% spesies mikroba di Bumi.
Subjek utama mikrobiologi lingkungan adalah mikroorganisme. Mikroorganisme merupakan makhluk hidup terkecil di bumi, namun memegang peranan penting bagi kehidupan manusia dan lingkungan. Mikroorganisme merupakan jasad hidup yang mempunyai ukuran sangat kecil.Setiap sel tunggal mikroorganisme memiliki kemampuan untuk melangsungkan aktivitas kehidupan antara lain dapat mengalami pertumbuhan, menghasilkan energi dan bereproduksi dengan sendirinya. Mikroorganisme memiliki fleksibilitas metabolisme yang tinggi karena mikroorganisme ini harus mempunyai kemampuan menyesuaikan diri yang besar sehingga apabila ada interaksi yang tinggi dengan lingkungan menyebabkan terjadinya konversi zat yang tinggi pula. Akan tetapi karena ukurannya yang kecil, maka tidak ada tempat untuk menyimpan enzim-enzim yang telah dihasilkanBanyak sekali tipe mikroba di bumi. Kita hanya mengetahuinya tidak lebih dari 1% dari jumlah spesies mikroba di bumi. Mikroba berada di sekeliling kita, di udara, tanah, dan air. Dalam satu gram tanah terdapat 1 miliar mikroba yang terdiri dari ribuan spesies.
Beberapa jenis mikroorganisme sendiri contohnya adalah fungi, bakteri, dan virus .Fungi adalah nama regnum dari sekelompok besar makhluk hidup eukariotik heterotrof yang mencerna makanannya di luar tubuh lalu menyerap molekul nutrisi ke dalam sel-selnya. Fungi memiliki bermacam-macam bentuk, sedangkan virus adalah parasit berukuran mikroskopik yang menginfeksi sel organisme biologis. Virus bersifat parasit obligat, hal tersebut disebabkan karena virus hanya dapat bereproduksi di dalam material hidup dengan menginvasi dan memanfaatkan sel makhluk hidup karena virus tidak memiliki perlengkapan selular untuk bereproduksi sendiri.
Lalu bakteri dari kata Latin bacterium (jamak, bacteria), adalah kelompok besar organismeprokariota, selain archaea, yang berukuran sangat kecil serta memiliki peran besar dalam kehidupan di bumi.Struktur sel bakteri relatif sederhana: tanpa nukleus/inti sel, kerangka sel, dan organel-organel lain seperti mitokondria dan kloroplas.
Mikroorganisme dapat bertahan di beberapa lingkungan yang paling ekstrem di planet ini dan beberapa dapat bertahan pada suhu tinggi, seringkali di atas 100 ° C, seperti yang ditemukan di geyser, perokok hitam, dan sumur minyak. Beberapa ditemukan di habitat yang sangat dingin dan yang lainnya mengandung garam, air garam, asam, atau alkali. Rata-rata gram tanah mengandung sekitar satu miliar (1.000.000.000) mikroba yang mewakili beberapa spesies.
Mikroorganisme memiliki dampak khusus pada keseluruhan biosfer. Mereka adalah tulang punggung ekosistem dari zona dimana cahaya tidak dapat mendekat. Di zona seperti itu, bakteri chemosynthetic hadir yang memberikan energi dan karbon pada organisme lain di sana. Beberapa mikroba adalah dekomposer yang memiliki kemampuan untuk mendaur ulang nutrisi. Jadi, mikroba memiliki peran khusus dalam siklus biogeokimia.
Mikroba, terutama bakteri, sangat penting dalam arti bahwa hubungan simbiosis mereka (baik positif maupun negatif) memiliki efek khusus pada ekosistem. Mikroorganisme adalah agen yang efektif biaya untuk remediasi in situ limbah domestik, pertanian dan industri dan polusi bawah permukaan di tanah, sedimen dan lingkungan laut. Kemampuan masing-masing mikroorganisme untuk menurunkan limbah beracun bergantung pada sifat masing-masing kontaminan. Karena sebagian besar situs biasanya terdiri dari beberapa jenis polutan, pendekatan biodegradasi mikroba yang paling efektif adalah dengan menggunakan campuran jenis/strain bakteri, masing-masing spesifik untuk degradasi satu atau lebih jenis kontaminan.
Sangat penting untuk memantau komposisi konsorsium bakteri asli dan yang ditambahkan untuk mengevaluasi tingkat aktivitas bakteri, dan untuk memungkinkan modifikasi nutrisi dan kondisi lain untuk mengoptimalkan proses bioremediasi. Pada biodegradasi minyak, minyak bumi bersifat toksik dan pencemaran lingkungan oleh minyak menyebabkan perhatian utama kajian ekologi. Tumpahan minyak di wilayah pesisir dan laut terbuka tidak dapat ditembus dan mitigasi sulit, namun sebagian besar minyak dapat dihilangkan dengan aktivitas penguraian mikroorganisme hidrokarbon, khususnya bakteri hidrokarbonoklastik (HCB). Organisme ini dapat membantu memperbaiki kerusakan ekologi yang disebabkan oleh pencemaran minyak habitat laut. HCB juga memiliki aplikasi bioteknologi potensial di bidang bioplastik dan biokatalisis.
Degradasi Senyawa Aromatik oleh strain Acinetobacter
Acinetobacter yang diisolasi dari lingkungan mampu menurunkan berbagai senyawa aromatik. Rute utama untuk tahap akhir asimilasi ke metabolit sentral adalah melalui katekol atau protokatechuat (3,4-dihidroksibenzoenzoat) dan jalur beta-ketoadipat, dan keragaman dalam genus terletak pada penyaluran substrat pertumbuhan, yang sebagian besar bersifat alami. produk asal tumbuhan, ke jalur ini.
Analisis Biotreatment
Biotreatment Limbah, pengolahan limbah dengan menggunakan organisme hidup, merupakan alternatif ramah lingkungan untuk pilihan lainnya. Bioreaktor telah dirancang untuk mengatasi berbagai faktor pembatas proses biotreatment dalam sistem yang sangat terkontrol. Fleksibilitas dalam desain bioreaktor ini memungkinkan perlakuan berbagai limbah dalam kondisi optimal. Sangat penting untuk mempertimbangkan berbagai mikroorganisme dan sejumlah besar analisis sering dibutuhkan.
Genomik Lingkungan
Cyanobacteria Penerapan biologi molekuler dan genomik terhadap mikrobiologi lingkungan telah menyebabkan ditemukannya kompleksitas yang sangat besar pada komunitas mikroba alami. Diversity surveying, community fingerprinting, dan interogasi fungsional populasi alami telah menjadi umum, dimungkinkan oleh teknik baterai molekuler dan bioinformatika. Studi terbaru tentang ekologi Cyanobacteria telah mencakup banyak habitat dan telah menunjukkan bahwa komunitas cyanobacterial cenderung spesifik habitat dan keragaman genetik banyak disembunyikan di antara jenis morfologi yang sederhana. Teknik molekuler, bioinformatika, fisiologis, dan geokimia telah digabungkan dalam studi komunitas alami bakteri ini.

0 komentar:

Posting Komentar